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化学方法主要是运用各种化学或者生物消泡剂来消除表面活性剂以达到消泡的目的。其机理主要有：消泡剂降低泡沫的机械强度，同时降低液膜表面黏度，两方面的作用再加上其他的一些相对较小作用因素的相互作用，足可以消除泡沫。这种方法较为简单方便，消泡剂种类繁多，消泡效率极高，是目前应用最为广泛的消泡方式。
对消泡剂的研究进展进行了梳理。总结出消泡剂发展的4个阶段，分别为以矿物油、脂肪酸及脂肪酸酯、脂肪酰胺、低级醇类等有机物为代表的第一代；以聚醚类消泡剂为代表的第二代；以有机硅消泡剂为代表的第三代和以聚醚改性聚硅氧烷类消泡剂为代表第四代。对聚醚改性硅油消泡剂消泡机理进行了研究，结果发现，“水一油．水”是其主要消泡方式。消泡剂在发酵行业中的应用，通过在150m3发酵罐上实际应用比较了有机硅类和聚醚类消泡剂的优缺点，得出聚醚类消泡剂是符合发酵行业消泡的消泡剂。研制出一种专用高效消泡剂，其专门用于糖蜜酒精发酵中，通过与其他几种主流消泡剂进行对比试验，发现其具有明显高于其他消泡剂的消泡性能。对应用于面包酵母生产中的消泡剂进行了对比研究，发现烷基脂肪酸酯的消泡效果最好。有机硅消泡剂在味精发酵中的应用进行研究，发现其具有明显的消泡速度快、用量少的特点并可以提高产能和发酵单位，非常适合味精发酵生产过程之中。程玉来等旧研究了有机硅消泡剂在豆制品加工中的应用，发现消泡用时和消泡剂用量都有大幅度的降低。
